通过采集临床典型病例的病料，在显微镜下观察其病理切片变化；以及分离细菌等病原微生物后发现，造成当前鸡消化道病比较难治的原因：一是，造成感染和发病的以非常规病原微生物及其产物为主。致使常规药物或单药对它们的控制效果比较差。二是，各种毒素所表现的总体水平持续较高，机体的调节能力跟不上来造成蓄积。由于其多来源，致使仅靠抗菌药的作用是不行的。