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Hao Zhang，Chuangchao Zou，Ouyang Peng，Usama Ashraf，Qiuping Xu，Lang Gong，Baochao Fan，Yun Zhang，Zhichao Xu，Chunyi Xue，Xiaona Wei，Qingfeng Zhou，Xiaoyan Tian，Hanqin Shen，Bin Li，Xiangbin Zhang，Yongchang Cao
PMID：36869744；PMCID：PMC10027654
DOI：10.1093/molbev/msad052
猪流行性腹泻病毒（PEDV）可能起源于蝙蝠，在猪群中造成重大危害并广泛流行。然而，PEDV的流行病学、进化和传播情况仍不清楚。本研究对11年中收集到的149 869份猪粪便和肠道组织进行研究发现，PEDV是导致动物腹泻最主要的病毒。对672株PEDV进行全基因组和进化分析，发现快速变异的PEDV基因2型（G2）毒株是全球主要的流行毒株，可能与G2型靶向疫苗的使用有关；G2病毒的进化模式存在地域偏差：在韩国的进化速度很快，但在中国的重组速度最快。此外，PEDV的时空传播路线显示，德国和日本分别是PEDV在欧洲和亚洲传播的主要枢纽。本文为PEDV的流行病学、进化和传播提供了新的见解，为预防和控制PEDV和其他冠状病毒奠定了基础。https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36869744/Yajing Guo，Guangzhi Yan，Shengnan Chen，Hui Han，Jiaming Li，Haoquan Zhang，Shicheng Luo，Mingjie Liu，Qingqing Wu，Qingxian Li，Changchun Tu，Liangzong Huang，Wenjie Gong
PMID：36204286；PMCID：PMC9530791
DOI：10.3389/fvets.2022.1009103
猪细小病毒（PPVs）是一类小型非包膜病毒，目前已发现7种基因型（PPV1~7）。本研究通过高通量测序（HTS）技术，从广东省猪繁殖与呼吸综合征病毒阳性样本中初步鉴定出一种新型PPV，暂命名为PPV8。PPV8-GDJM2021的近全长基因组长度为4 380 bp，有两个重叠的开放阅读框（ORF），分别编码NS1和VP1。测序结果表明：PPV8在基因组水平上与PPV1~7的同源性为16.23%~44.18%，与PPV1的同源性相对最高；PPV8-GDJM2021与PPV1和猪bufavirus（PBuV）NS1蛋白序列同源性为31.86 ~ 32.68%，与原细小病毒属成员相邻，形成一个独立的分支。在1990—2021年收集的211份临床样本中，有37份样本（17.5%）检出PPV8，这些样本分布于我国12个地区，时间跨度长达24年（1998—2021年）。
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36204286/
