近年来我国动物疫病时有发生，不仅影响了我国畜牧业的发展，尤其是我国加入世贸组织之后，随着动物产品进出口规模扩大，对产品质量提出了更高的要求。为提升我国动物产品进出口的竞争力，我们务必要做好动物防疫工作。我国地域辽阔，基层是畜牧工作开展的重点区域，基层畜牧业是我国动物产品生产的主要来源，但基层畜牧工作也最容易发生问题，我们要充分重视这些问题，从问题的根源出发进行改善。1. 管理体制问题。现阶段我国的畜牧管理体制存在条块分割、各自为政的现象，削弱了畜牧管理的调控。我国的畜牧部门只负责畜牧生产，商业部门负责产品加工与流通，粮食部门和外贸部门分别负责收购与出口，呈现“政出多门”的现象。在此情况下容易产生推诿扯皮，严重妨碍了动物防疫工作的发展。
2. 防疫工作人员水平亟待提升。畜牧工作需要从业人员有扎实的专业素质与比较丰富的从业经验，在许多人看来，畜牧工作是一个没有前途的工作，大部分不愿意从事畜牧专业，导致很大的人才缺口。同时，在人力资源不足的情况下，我国从事畜牧业的人员呈现老龄化趋势，这类人员的专业知识来源于工作经验和较少的医学知识，面对愈发复杂的动物疫情，其往往一句经验判断，加大了误判的风险，很可能对动物造成二次伤害，使得简单的问题复杂化，加大了后期治疗的成本，降低了工作的效率。对于基层畜牧工作而言，由于地区广泛、人员松散，其管理层人员也没有形成明确的认识，在部分地方，对于引进的人才往往以“师傅带徒弟”的模式进行培训、管理，这种相对不够专业的培训方式，使得我国畜牧工作中的一些问题被延续，难以遏制。3. 防疫手段单一。在我国大部分偏远地区、农村地区，动物防疫仍然是传统的检疫防疫手段，这种手段过于单一，效果不够显著，对资源的浪费也比较明显，其不符合时代发展的需要。然而由于地区限制、经济水平的差异使得我国大部分基层地区仍然使用这种较为传统的防疫手段，其实并不利于动物防疫工作的有效开展。4. 设备落后，维修困难。我国对于动物检疫工作的研究起步较晚， 投入较少，使得我国设备处于整体落后的局面，不能及时对动物进行检疫。同时，由于我国地区发展的差距，有的地区无法负担设备的购买、运输费用，所以设备无法统一，使得地区之间的动物检疫差距较大。由于我国地域辽阔，设备也不够统一，故我国对于设备的定期全面检查不到位，部分地区设备维修不及时，降低了检疫工作的效率。在实践中，基层畜牧工作者应当深入当地的养殖，对养殖情况进行深入全面了解，对动物防疫工作中存在的问题进行总结，从实际出发，结合养殖环境及养殖方式对动物防疫工作中存在的问题进行指导，同时要不断深化自己知识储备，提高检验水平、检验能力，从而更好的开展基层畜牧动物防疫工作，提高我国动物产品的安全和质量。1. 建立健全动物检疫管理机制。在实践中要通过完善检疫工作的管理机制来激励地方畜牧站管理人员、从业人员的科学认识，保障动物检疫环节的顺利开展。可以通过体制提高相关工作人员的待遇来激励工作人员积极投入工作，保障动物检疫工作的顺利进行。同时，还要确立动物检疫工作的监督工作，以及时的监督来提高动物检疫工作的效率，提高动物检疫工作的价值。2. 引进先进设备。基于我国地区差异明显的情况，应当由政府牵头加大动物检疫设备购置的补贴，以提高地方购买动物检疫设备购买的热情。根据实际距离进行划分，形成以点带面的检疫设备购置，优化资源配置并且提高动物检疫工作的效率。
3. 提高动物检疫人员专业素质。针对从业人员，要通过每年的定期培训，不断为从业人员灌输新知识、新理念，提高从业人员的科学认识，强化专业素养，提高其在实践建议过程中的判断能力，提高动物防疫工作的准确性。4. 加大科学检疫宣传。加大动物防疫工作的宣传力度在于提高社会对于使用科学设备进行防疫的认识，要让动物饲养人员明确认识到科学检疫的重要性，要让他们意识到动物防疫工作投入成本对动物健康的积极作用，从而提升饲养人员的认识，提升行业参与的积极性。
